1、本质不同。鳗鱼是指属于鳗鲡目分类下的物种总称，鳗鱼属鱼类，似蛇，但无鳞，一般产于咸淡水交界海域。鳝鱼属合鳃鱼目，合鳃鱼科，黄鳝属。亦称黄鳝、鱓鱼、罗鳝、蛇鱼、血鳝、常鱼、长鱼。
2、身处环境不同。黄鳝常生活在稻田、小河、小溪、池塘、河渠、湖泊等淤泥质水底层，在中国各地均有生产，以中国长江流域、辽宁和天津产量较多。鳗鱼喜欢在清洁、无污染的水域栖身，是世界上最纯净的水中生物。鳗鱼在陆地的河川中生长，成熟后洄游到海洋中产卵地产卵，一生只产一次卵，产卵后就死亡。
3、营养价值不同。鳗鱼具有补虚养血、祛湿、抗痨等功效，是久病、虚弱、贫血、肺结核等病人的良好营养品。黄鳝有补血、补气、消炎、消毒、除风湿等功效，黄鳝具有一定的药用价值。
