kegg分析结果怎么用?
kegg一般采用条形图、点图或棒棒糖图显示。
转录组数据中如何找go富集分析上下调基因?
如何从转录组测序数据判断kegg富集的意义?提取样品总rna后,用带有oligo(dt)的磁珠富集真核细胞mrna(对于原核生物,用试剂盒去除rrna,然后进行下一步)。
添加片段缓冲液以将mrna破碎成短片段。以mrna为模板,用随机六聚体合成第一条cdna链。然后加入缓冲液、dntps、rna酶h和dna聚合酶i合成第二条cdna链,用qaquick法合成第二条cdna链,纯化pcr试剂盒,加入eb缓冲液洗脱,末端修复,a+dna测序,琼脂糖凝胶电泳选择片段大小。最后进行pcr扩增,并用illuminahiseq2000对测序文库进行测序。
go和kegg富集分析有什么作用?
go和kegg富集分析主要是研究差异表达基因的功能鉴定,从而探讨不同操作的生物学意义。
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